Japanmatten sind ein hervorragendes Filtermedium. Durch die besonders feste Faserstruktur wird ein guter Wasserdurchfluss und eine große Ansiedlungsfläche für Bakterien gewährleistet. Japanmatten brauchen zum Reinigen nicht entnommen werden, wenn der grobe Schmutz durch Filterbürsten abgefangen wird. Ein Reinigen ist somit während der ganzen Saison nicht erforderlich. Die Matten werden so gesetzt, dass das Wasser problemlos durchströmen kann und somit der Filter nicht verstopft. Bei jeder Reinigung würde sonst ein großer Teil der nützlichen Filterbakterien zerstört.